芬戈莫德由鞘氨醇激酶代谢为活性代谢物芬戈莫德磷酸。芬戈利莫磷酸是一种1-磷酸鞘氨醇受体调节剂，与1-磷酸鞘氨醇受体1、3、4和5具有高亲和力结合。磷酸芬戈利莫德可阻止淋巴细胞从淋巴结中排出，从而减少外周血中淋巴细胞的数量。芬戈利莫德在多发性硬化症中发挥治疗作用的机制尚不清楚，但可能涉及淋巴细胞迁移到中枢神经系统的减少。
最常见的不良反应为头痛、肝转氨酶升高、腹泻、咳嗽、流感、鼻窦炎、背痛、腹痛和四肢疼痛。
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